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Primer Premier Win10是一款非常專業(yè)的引物設(shè)計(jì)軟件,該軟件支持引物設(shè)計(jì)、限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)分析和DNA基元(motif)查找等功能,真正做到快速化和自動(dòng)化操作流程,帶來無與倫比的設(shè)計(jì)體驗(yàn),并且該版本為破解版,內(nèi)置破解補(bǔ)丁,免激活碼即可永久免費(fèi)進(jìn)行使用。
1、主要界面可分為序列編輯窗口(Genetank),引物設(shè)計(jì)窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和紋基分析窗口(Motif)四大塊
2、該軟件就是用來進(jìn)行引物設(shè)計(jì)的
3、可以簡單地通過手動(dòng)拖動(dòng)鼠標(biāo)以擴(kuò)增出相應(yīng)片段所需的引物
4、在手動(dòng)的任何時(shí)候,下面顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)等。也可以給定條件,讓軟件自動(dòng)搜索引物,并將引物分析結(jié)果顯示出來
5、進(jìn)行這些操作非常簡單
1、下載軟件壓縮包文件,點(diǎn)擊“PP624Installer.exe”根據(jù)提示完成原版安裝即可
2、關(guān)閉軟件,將crack文件夾下的patcher.jar文件復(fù)制到Premier 6安裝根目錄下…\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM624文件夾中。
默認(rèn)目錄為:C:\Program Files\Primer Premier 6.24
3、在開始菜單—運(yùn)行中輸入CMD,打開命題提示符窗口
4、用CD命令定位至目錄:
cd C:\Program Files\Primer Premier 6.24\http\Dwww.premierbiosoft.com\P80\DMIUpdater\DMPP\DM624
7、然后在光標(biāo)后輸入:java -jar patcher.jar ,回車即可破解成功
一、限制性酶切點(diǎn)分析及基元查找功能
1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切點(diǎn)分析及基元查找功能比較簡單,點(diǎn)擊該功能按鈕后,選擇相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶或基元(如-10 序列,-35 序列等),按確定即可
2.常見的限制性內(nèi)切酶和基元一般都可以找到,你還可以編輯或者添加新限制性內(nèi)切酶或基元
二、引物設(shè)計(jì)
1.打開DNA序列后點(diǎn)擊按鈕primer,出現(xiàn)“search criteria”窗口,有多種參數(shù)可以調(diào)整
2.搜索目的(Seach For)有三種選項(xiàng),PCR 引物(PCR Primers)、測序引物(Sequencing Primers)和雜交探針(Hybridization Probes)
3.搜索類型(Search Type)可選擇分別或同時(shí)查找上、下游引物(Sense/Anti-sense Primer,或Both),或者成對(duì)查找(Pairs),或者分別以適合上、下游引物為主(Compatible with Sense/Anti-sense Primer)。另外還可改變選擇區(qū)域(Search Ranges),引物長度(Primer Length),選擇方式(Search Mode),參數(shù)選擇(Search Parameters)等等
3.使用者可根據(jù)自己的需要設(shè)定各項(xiàng)參數(shù)。如果沒有特殊要求,建議使用默認(rèn)設(shè)置。然后按search,隨之出現(xiàn)的Search Progress 窗口中顯示Search Completed 時(shí),再按OK,這時(shí)搜索結(jié)果以表格的形式出現(xiàn),有三種顯示方式,上游引物(Sense),下游引物(Anti-sense),成對(duì)顯示(Pairs)。默認(rèn)顯示為成對(duì)方式,并按優(yōu)劣次序(Rating)排列,滿分為100,即各指標(biāo)基本都能達(dá)標(biāo)
三、引物點(diǎn)擊
1.點(diǎn)擊其中一對(duì)引物,如第1#引物,并把上述窗口挪開或退出,顯示“Peimer Premier”主窗口,所得結(jié)果分三部分,
2.模板及產(chǎn)物位置,中間是所選的上下游引物的一些性質(zhì),最下面是四種重要指標(biāo)的分析,包括發(fā)夾結(jié)構(gòu)(Hairpin),二聚體(Dimer),錯(cuò)誤引發(fā)情況(False Priming),及上下游引物之間二聚體形成情況(Cross Dimer)
3.當(dāng)所分析的引物有這四種結(jié)構(gòu)的形成可能時(shí),按鈕由變成,點(diǎn)擊該按鈕,在左下角的窗口中就會(huì)出現(xiàn)該結(jié)構(gòu)的形成情況
4.一對(duì)理想的引物應(yīng)當(dāng)不存在任何一種上述結(jié)構(gòu),因此最好的情況是最下面的分析欄沒有,只有。值得注意的是中間一欄的末尾給出該引物的最佳退火溫度
四、引物修飾編輯
1.在需要對(duì)引物進(jìn)行修飾編輯時(shí),如在5’端加入酶切位點(diǎn),可點(diǎn)擊,然后修改引物序列
2.若要回到搜索結(jié)果中,則點(diǎn)擊按鈕。如果要設(shè)計(jì)簡并引物,只需根據(jù)源氨基酸序列的物種來源選擇前述的八種遺傳密碼規(guī)則,反推至DNA 序列即可3.對(duì)簡并引物的分析不需像一般引物那樣嚴(yán)格
4.總之,“Premier”有優(yōu)秀的引物自動(dòng)搜索功能,同時(shí)可進(jìn)行部分指標(biāo)的分析,而且容易使用,是一個(gè)相當(dāng)不錯(cuò)的軟件
標(biāo)簽: Primer Premier 引物設(shè)計(jì)
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