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SnapGene 是一款功能強(qiáng)大的日常分子生物學(xué)軟件。旨在為用戶提供完善的計(jì)劃,可視化和記錄您的日常分子生物學(xué)程序的解決方案。擁有友好的用戶界面,可以方便,全面地記錄我們經(jīng)常生成的所有結(jié)構(gòu)。可在SnapGene中完成所有克隆,并且優(yōu)化改善你的策略,快速創(chuàng)建質(zhì)粒圖譜,并提供優(yōu)雅、信息豐富的窗口,用于模擬各種常見的克隆和PCR方法。
1.In-Fusion克隆:一種多用途、多用途的方法來(lái)創(chuàng)建無(wú)國(guó)界的基因連接。SnapGene是第一個(gè)模擬這種方法的軟件。只要選擇你想要混合的DNA片段,程序就會(huì)設(shè)計(jì)它。
2.Gibson Assembly:許多研究人員在不使用限制性酶的情況下將Gibson Assembly轉(zhuǎn)化為質(zhì)粒。通過(guò)PCR將DNA片段連接起來(lái)進(jìn)行干擾。
3.PCR及誘變:經(jīng)引物設(shè)計(jì)后,可用于常規(guī)PCR克隆、共PCR擴(kuò)增或誘變。得到的DNA序列文件可以立即進(jìn)行進(jìn)一步的操作。
4.自動(dòng)文檔化:自動(dòng)記錄模擬項(xiàng)目中的步驟。每次編輯或模擬序列時(shí),此方法都會(huì)自動(dòng)記錄在圖形歷史記錄中。在模擬DNA的結(jié)構(gòu)之后,您可以使用歷史作為實(shí)驗(yàn)協(xié)議。
5.瓊脂糖凝膠電泳:使用先進(jìn)的算法創(chuàng)建逼真的瓊脂糖模擬。有限的部分顯示在三種模擬凝膠格式,數(shù)值列表和序列圖。您可以使用這種模擬凝膠來(lái)計(jì)劃診斷約束或?qū)D像與預(yù)測(cè)模式進(jìn)行比較。
1.限制性站點(diǎn)指標(biāo):確認(rèn)限制性網(wǎng)站適合克隆。獨(dú)特性,甲基化敏感性,特殊性質(zhì)以粗體顯示獨(dú)特的限制性位點(diǎn),或選擇自動(dòng)定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組,不要被愚弄,因?yàn)橄拗菩晕稽c(diǎn)被Dam,Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動(dòng)用星號(hào)標(biāo)記該站點(diǎn),利用工具提示來(lái)避免有問(wèn)題的限制網(wǎng)站。
2.限制性克隆:可視化克隆過(guò)程的所有方面,如果您已經(jīng)考慮過(guò)程,則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過(guò)程存在設(shè)計(jì)缺陷,則可以捕獲并糾正錯(cuò)誤。
3.PCR:模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR,使用您自己的引物,或要求SnapGene自動(dòng)設(shè)計(jì)引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲(chǔ)模板和引物。
4.重疊延伸PCR:通過(guò)重疊延伸PCR融合片段,最多可組裝八個(gè)碎片。選擇要連接的片段及其方向,SnapGene將設(shè)計(jì)引物。
5.引物定向誘變:使用誘變引物進(jìn)行定點(diǎn)誘變,選擇誘變引物,按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。
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