網友評分: 5分
Arlequin是專業(yè)的人類遺傳學數(shù)據分析軟件,為從事醫(yī)學、生物學研究的學者設計,擁有可進行AMOVA計算、中性檢驗、錯配分布等功能,例如:大量的分子序列數(shù)據和傳統(tǒng)的等基因頻率,并提供了很多的方法和統(tǒng)計學檢驗,能夠滿足用戶多種遺傳學分析方便的需求。
1、Molecular diversity(分子多態(tài)性)
2、Mismatch distribution(錯配分布)
3、Haplotype frequency estimation(單倍型頻率估計)
4、Linkage disequilibrium(連鎖不平衡:檢測不同位點上等位基因的非隨機關聯(lián))
5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈溫—伯格平衡)
6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性檢驗)
7、Fu`s neutrality test(Fu中性檢驗)
8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性檢驗)
以上三個中性檢驗都是基于無限位點模型,適用于DNA sequence 和 RFLP單倍型。
9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合檢驗,檢測人群的均一性或同質性和中性選擇等)
10、Minimu Spanning Network(MSN,最小擴張樹或稱之為最小支撐樹,,基于分子差異)
11、AMOVA 分子差異度分析,用以評測人群的遺傳結構
12、Pairwise genetic distances (遺傳距離的估計)
13、Exact test of population differentiation (檢測隨機交配群體單倍型的非隨機分布)
14、Assignment test of genotype (通過估計等位基因頻率將單個基因型分配到特定的人群中)
關于本站|下載幫助|下載聲明|軟件發(fā)布|聯(lián)系我們
Copyright ? 2005-2024 virtualinsta360.com.All rights reserved.
浙ICP備06019006號-1 浙公網安備33038102330474號